第231章 KRAS突变(第2/3页)
pocket),设计一种具有高亲和力的非共价抑制剂,直接卡进去……
可是,拥有思路和付诸实践,完全是两件事。
江河拿起笔,在白纸上画出kras蛋白的大致三维构象,然后在这个构象旁,打了一个大大的问号。
想要合成这种靶向药,首先需要进行高通量的药物筛选。
在没有后世成熟的alphafold等人工智能辅助预测蛋白结构的情况下,
只能依靠最原始的方法:
蛋白质重组表达、结晶,然后利用x射线衍射技术去解析它在不同化合物结合状态下的结构。
在这个年代,真的难如登天。
有时候为了长出一颗高质量的晶体,需要耗费几个月甚至半年的时间去不断调整溶液的酸碱度、温度和沉淀剂浓度。
而这还仅仅是第一步。
后续的核磁共振(nmr)分析、质谱仪检测、数十万种小分子的分子对接计算……
江河写满了一张纸。
设备太慢了,算力太弱了。
如果在08年推进这个项目,以目前的硬件水平,光是跑完前期的分子对接库,可能就需要三年甚至更久。
“呼——”
他长长地吐出一口浊气。
如果现有的设备达不到要求,自己搞不好还得先去拉投资、造设备、搞超算平台。
一条本就布满荆棘的路,前面突然又横亘起几座大山。
困难重重,但他并不放弃。
把那张纸对折,收进口袋里。
回想起沈钰在西山餐厅戴上戒指时那明媚笑脸,江河的眼神逐渐变得坚毅。
关关难过关关过,实在不行就去请教关关公子……
一定能有办法的,一定。
等到新一波的数据跑完并确认无误后。
江河决定去一趟图书馆。
既然决定要从硬件层面突破,就得先摸清楚08年当下的生物制药设备和超算架构,到底发展到了什么阶段。
南医大的图书馆。
老位置。
程溪瑶又刷新在这里。
江河走过去坐下,问:“今天没休息?”
程溪瑶动作一愣,抬起头看到是江河,立刻挺直腰板道:“老大,早!”
江河看了一眼窗外已经彻底暗下来的夜幕,无奈地说:“不早了吧,天都黑了。”
程溪瑶有些不好意思地吐了吐舌头。
随后,她将桌上的文件推到江河面前,兴致高昂地分享起来:
“老大,关于宫颈糜烂过度医疗的流调项目,今天有了巨大推进!之前我去几家基层医院发问卷,那些老资格的主任和私立医院的医生根本不理我,甚至把我轰出来,说我一个学生懂什么。”
“但是!自从执老在丁香园上发了那篇长篇驳斥文章后,情况就大变特变了!”
“我把执老的帖子打印出来,附在调查问卷后面,现在我拿去跟别人说,信服力高多了,甚至有几位妇产科的年轻医生主动联系我,愿意提供他们科室的接诊数据!”
江河点点头,给予肯定:“那就好,能推进下去就是好事,辛苦了。”
听到江河的肯定,程溪瑶觉得这几天的奔波都值了。
她转而好奇地问:“老大,项目不是都已经成功了吗?大家都在休息,你今天来图书馆是做什么的?”
“来查一些设备的情况。”
“设备?”
“嗯,比如目前最先进的x射线衍射仪的解析精度,还有几家跨国医药公司目前用的仪器的型号参数。”
程溪瑶虽然不明白江河为什么突然跨界去查这些偏向于器械和制药的东西,但没有多问。
“正好我这边收尾了,我帮你吧,老大。”
江河想了想,没有拒绝。
确实需要查阅的资料太多,有个人帮忙能节省不少时间。
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可是,拥有思路和付诸实践,完全是两件事。
江河拿起笔,在白纸上画出kras蛋白的大致三维构象,然后在这个构象旁,打了一个大大的问号。
想要合成这种靶向药,首先需要进行高通量的药物筛选。
在没有后世成熟的alphafold等人工智能辅助预测蛋白结构的情况下,
只能依靠最原始的方法:
蛋白质重组表达、结晶,然后利用x射线衍射技术去解析它在不同化合物结合状态下的结构。
在这个年代,真的难如登天。
有时候为了长出一颗高质量的晶体,需要耗费几个月甚至半年的时间去不断调整溶液的酸碱度、温度和沉淀剂浓度。
而这还仅仅是第一步。
后续的核磁共振(nmr)分析、质谱仪检测、数十万种小分子的分子对接计算……
江河写满了一张纸。
设备太慢了,算力太弱了。
如果在08年推进这个项目,以目前的硬件水平,光是跑完前期的分子对接库,可能就需要三年甚至更久。
“呼——”
他长长地吐出一口浊气。
如果现有的设备达不到要求,自己搞不好还得先去拉投资、造设备、搞超算平台。
一条本就布满荆棘的路,前面突然又横亘起几座大山。
困难重重,但他并不放弃。
把那张纸对折,收进口袋里。
回想起沈钰在西山餐厅戴上戒指时那明媚笑脸,江河的眼神逐渐变得坚毅。
关关难过关关过,实在不行就去请教关关公子……
一定能有办法的,一定。
等到新一波的数据跑完并确认无误后。
江河决定去一趟图书馆。
既然决定要从硬件层面突破,就得先摸清楚08年当下的生物制药设备和超算架构,到底发展到了什么阶段。
南医大的图书馆。
老位置。
程溪瑶又刷新在这里。
江河走过去坐下,问:“今天没休息?”
程溪瑶动作一愣,抬起头看到是江河,立刻挺直腰板道:“老大,早!”
江河看了一眼窗外已经彻底暗下来的夜幕,无奈地说:“不早了吧,天都黑了。”
程溪瑶有些不好意思地吐了吐舌头。
随后,她将桌上的文件推到江河面前,兴致高昂地分享起来:
“老大,关于宫颈糜烂过度医疗的流调项目,今天有了巨大推进!之前我去几家基层医院发问卷,那些老资格的主任和私立医院的医生根本不理我,甚至把我轰出来,说我一个学生懂什么。”
“但是!自从执老在丁香园上发了那篇长篇驳斥文章后,情况就大变特变了!”
“我把执老的帖子打印出来,附在调查问卷后面,现在我拿去跟别人说,信服力高多了,甚至有几位妇产科的年轻医生主动联系我,愿意提供他们科室的接诊数据!”
江河点点头,给予肯定:“那就好,能推进下去就是好事,辛苦了。”
听到江河的肯定,程溪瑶觉得这几天的奔波都值了。
她转而好奇地问:“老大,项目不是都已经成功了吗?大家都在休息,你今天来图书馆是做什么的?”
“来查一些设备的情况。”
“设备?”
“嗯,比如目前最先进的x射线衍射仪的解析精度,还有几家跨国医药公司目前用的仪器的型号参数。”
程溪瑶虽然不明白江河为什么突然跨界去查这些偏向于器械和制药的东西,但没有多问。
“正好我这边收尾了,我帮你吧,老大。”
江河想了想,没有拒绝。
确实需要查阅的资料太多,有个人帮忙能节省不少时间。
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